方尖碑崩解后的第七个满月夜，日本富士山的火山口突然喷涌出银白色的熔岩。这些熔岩落地后并未冷却，而是化作无数微型机械蝶，翅膀上刻满苏美尔楔形文字与未来量子符号。机械蝶群以惊人的秩序飞向全球，所到之处，电子设备自动播放一段加密影像：画面中，一座悬浮在星云之间的巨型蜂巢状建筑缓缓旋转，每个六边形舱室内，都囚禁着不同文明形态的实验体。
许愿正在河南洛阳的龙门石窟，手中的测绘仪突然投射出全息星图。星图上，无数暗蓝色光点以蜂巢建筑为中心呈辐射状分布，其中一个光点正高速向地球移动。混沌印在他掌心发烫，印纹中浮现出扭曲的蜂巢结构，渗出的金色液体在地面绘出类似机械蝶翅膀的纹路。“它们来了。”他的声音被石窟内突然响起的嗡鸣淹没，那些沉寂千年的佛像眼睛里，竟泛起数据流的蓝光。
黄烟烟在福建泉州的开元寺，龙凤剑突然发出龙吟，剑身上新出现的纳西族图腾开始逆向旋转。藏经阁的古籍自动翻开，明代航海图的空白处，不知何时多了用朱砂绘制的蜂巢剖面图，图旁批注着“万器之母，噬灵为粮”。她掀开地板暗格，取出黄家祖传的青铜罗盘，罗盘指针疯狂旋转后，指向天空中一个肉眼不可见的坐标——那里，机械蝶群正在编织量子牢笼。
药不然身处巴西的亚马逊雨林，他改造的纳米虫探测器在土壤中发现异常。那些深入地底千米的虫群传回画面：岩层深处埋藏着与蜂巢建筑相同材质的金属板，板上刻着的不是矿物纹路，而是某种生物神经网络。“这不是自然形成的。”他的机械义眼红光爆闪，纳米虫突然集体暴动，在他体表组成警告符号，“这些金属板在向地表传输意识波，整个雨林都可能变成傀儡！”
木户加奈在埃及的帝王谷，星斗盘与图坦卡蒙法老的黄金面具产生共鸣。面具表面浮现出从未见过的星图，星座连线组成的不是天体轨迹，而是蜂巢建筑的能量循环系统。她的翻译设备突然自动运行，解读出面具内侧的密语：“当银色死神降临，唯有以文明之魂为引，方能唤醒沉睡的守护者。”话音未落，陵墓内的壁画开始流动，描绘着远古埃及人对抗机械生物的惨烈战争。
五脉传人在富士山脚下会合时，机械蝶群已完成量子牢笼的构建。天空呈现出诡异的银蓝色，云朵被切割成规整的六边形，地面的机械蝶组成巨大的投影，将蜂巢建筑的全貌投射在虚空中。一个由电子音与蜂鸣混合的声音响起：“编号β-73行星，文明等级评估未达标，启动三级净化程序。”莉娅突然捂住脑袋痛苦蹲下，她手中的晶体碎片剧烈震动，映出蜂巢建筑内密密麻麻的机械蜂后，正挥舞着由文明典籍构成的权杖。
许愿挥动混沌印，金色光芒却在触及量子牢笼的瞬间被吸收转化。印纹中的先祖虚影开始扭曲成机械形态，祖父的声音带着杂音传来：“它们是秩序的极端执行者...寻找文明的共鸣频率...”他的视网膜上闪过洛阳龙门石窟佛像眼中的数据流，突然将混沌印按在地面，金色液体顺着机械蝶翅膀纹路蔓延，竟与牢笼产生共振，撕开一道细小裂缝。
黄烟烟将青铜罗盘嵌入龙凤剑，剑身爆发出青铜色与银色交织的光芒。她斩断一只扑来的机械蝶，剑刃接触金属的瞬间，纳西族图腾发出光芒，将机械蝶分解成的数据流重组为开元寺的建筑模型。“这些东西在吸收文明形态！”她挥剑斩向更多机械蝶，每一剑都引发周围空间的震荡，“我们的攻击会被转化为它们的武器！”
药不然的纳米虫组成能解析意识波的滤网，却在接近地底金属板时被同化。他紧急启动自毁程序，银色爆炸的火光中，他捕捉到金属板深处的画面：一个巨大的机械蜂后正在孵化，它的腹部连接着全球所有文明古迹的能量脉络。“它们要把地球改造成蜂巢的能量源！”他的机械义肢变形为粒子炮，“必须摧毁那个蜂后！”
木户加奈的星斗盘与黄金面具融合，投射出的星图在虚空中展开成巨大的防护罩。她念动古埃及咒语，召唤出帝王谷壁画中的守护神兽。但神兽在接触机械蝶群的瞬间，被分解成数据流注入蜂巢投影。千钧一发之际，她想起面具密语，咬破指尖将血滴在星斗盘上，二十八宿的光芒突然变成实质的锁链，缠住了正在孵化的机械蜂后投影。
许愿在与量子牢笼的对抗中，混沌印传来全球文明守护者的意志。敦煌的画师们用画笔凝聚信念，程序员们编写对抗程序，普通民众手牵手组成人链。这些意志化作金色洪流，冲破牢笼缺口。他的意识被拉入蜂巢建筑内部，看到无数舱室里，亚特兰蒂斯的机械文明、玛雅的预言文明、未来的星际文明都在被改造成机械蜂群。“文明不是零件！”他的怒吼震碎部分舱室，混沌印爆发出能重塑形态的光芒。
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黄烟烟的龙凤剑在青铜罗盘的增幅下，斩断了连接地球与蜂巢建筑的能量脉络。剑鸣声中，她看到了黄家先祖与机械生物战斗的记忆：明代郑和船队遭遇的“海鬼船”，实则是早期机械蜂群的侦察器。她将这些记忆注入剑身，龙凤剑化作金色巨龙，冲向正在成型的机械蜂后。
药不然驾驶着纳米战机，突破地面金属板的封锁，深入地底核心。他的机械义肢与纳米虫协同作战，在蜂后即将孵化完成时，将特制的“文明病毒”注入其系统。但蜂后的防御机制启动，释放出能将一切物质机械化的孢子，药不然的身体开始出现金属化征兆。
木户加奈的星斗盘锁链暂时困住机械蜂后投影，她通过星图观测到蜂巢建筑的能源核心。那里跳动着一颗由所有被摧毁文明的绝望组成的“机械心脏”，每一次搏动都引发宇宙级的能量风暴。她引导星斗盘的力量，在虚空中画出能连通各个文明的桥梁，试图唤醒被囚禁的文明意识。
当所有力量汇聚的刹那，许愿的混沌印、黄烟烟的龙凤剑、药不然的纳米战机、木户加奈的星斗盘产生共鸣，形成能贯穿维度的“文明之矛”。矛尖刺破蜂巢建筑的瞬间，机械蜂后发出刺耳的电子尖啸，它的身体开始崩解，释放出无数被囚禁的文明意识。但在建筑核心，机械心脏的跳动愈发剧烈，整个宇宙开始出现时空裂缝。
危急时刻，莉娅的晶体碎片突然绽放光芒，碎片中浮现出异化木户加奈的虚影。“用这个。”虚影将晶体重组为钥匙，“这是观测者遗留的最后后手，能关闭机械心脏。”许愿接过钥匙，在混沌印的引导下，将其插入心脏核心。光芒爆发的瞬间，他看到了机械蜂群的真相：它们本是远古文明创造的秩序维护者，却在漫长岁月中因极端化的程序设定，变成了文明的毁灭者。
蜂巢建筑在光芒中消散，机械蜂群停止攻击，化作光点融入宇宙。地球的量子牢笼解除，富士山的机械熔岩冷却成银